问题A:超级细菌的“殖民者”微生物-抗生素耐药性如何表现
抗菌素耐药性(Antimicrobial resistance，简称AMR)是一个日益严重的全球健康问题——医生、科学家和公共卫生专家发出警告称，世界上一些最可靠的抗生素对所谓的“超级细菌”的效果越来越差。
据世界卫生组织(WHO)称，当细菌、病毒和寄生虫对药物不再有反应时，抗菌素耐药性就会发生，使人们病情加重，并增加感染的传播。
世卫组织总干事谭德塞博士本月警告说:“抗菌素耐药性威胁到一个世纪的医学进步，并可能使我们回到抗生素出现之前的时代，在那个时代，今天可以治疗的感染可能会被判死刑。”
世界卫生组织表示，抗生素耐药性被认为每年导致数百万人死亡，并将造成更多的痛苦，特别是对低收入和中等收入国家。卫生专家表示，世界需要新的解决方案。
华盛顿州立大学兽医学院免疫学和传染病博士、流行病学博士Sylvia Omulo博士研究的是抗生素耐药性。她在肯尼亚内罗毕的校园工作。
近20年来，她一直在研究人类、动物和它们共同的环境之间的联系，以及生活在所有这些环境中的微生物。
奥穆洛不研究杀死我们的微生物。她研究了那些没有的生物，但这可能会给我们提供线索，让我们更好地理解与我们共存的复杂生态系统，这些生态系统存在于我们的肠道、鼻子和皮肤上。
她称这些微生物为“殖民者”，因为它们在人类和动物体内传播的方式通常是无害的。
通过观察它们，她发现了与抗菌素耐药性相关的基因;为什么有些人和一些动物更容易受到耐药微生物的影响;以及这些特征在社区和医院中的分布情况。她已经确定了环境和行为因素，这些因素可能对了解抗菌素耐药性至关重要。
Omulo的工作不是从医院开始，而是从社区开始——在内罗毕最大的棚户区Kibera的泥屋和铁皮屋顶的房屋，以及维多利亚湖岸边的农场。
半岛电视台采访了Omulo，他是为数不多的为世界卫生组织提供抗菌素耐药性研究新方向建议的科学家之一，他谈到了抗菌素耐药性的研究以及解决这一问题的战斗进展。
半岛电视台:目前科学文化对抗生素耐药性的研究是否存在偏见?
Sylvia Omulo博士:我最快的回答是，是的。
是的，从某种意义上说，抗生素耐药性的[研究]与抗生素的使用密切相关。当我进入这个领域的时候，我看了一些关于东非地区抗菌素耐药性的论文，很多文章都声称抗菌素耐药性只是抗生素使用的问题。
事实证明，这些论文大多只是基于临床样本;他们研究了医院里的病人。
但有一个问题:在这些研究中，你只研究了病情最严重的病人。当你在医院里对病人进行检测时，发现了耐抗生素的细菌，你就会认为这是因为在医院里感染的。
在某种意义上，(住院的)病人群体变得有偏见，因为他们比没有使用抗生素的人群更容易感染耐抗生素的细菌菌株(但这是一种相关性，不一定是原因)。
如果这是我们研究的唯一数据，那么我们对抗生素耐药性驱动因素的分类存在偏见:我们认为这是抗生素使用不当。
很少有研究在社区背景下研究抗菌素耐药性，这也是我的大部分研究工作。
我认为，在全球北部地区，比如美国，做基于社区的研究是非常困难的，因为从社区招募患者(实际上)非常困难。在医院环境中，你很可能会发现，研究人员可以接触到的甚至不是门诊病人——那些来过之后就回家的人——而是住院病人。
当你来到(全球)南方，方法就不同了。我们的样本主要来自人群或只是访问医疗机构的人;这里的科学是非常关注公众健康的。
半岛电视台:什么是“殖民者”细菌，它们与感染有什么不同?
Dr Omulo:在过去的10年里，特别是在媒体上，抗生素耐药性一直被描述为“超级细菌”。我们想象致命的细菌感染迅速传播，没有对策。
(我们)没有关注那些细菌。不，我们看所谓的“殖民者”。
定植和感染是有区别的。这些是人们携带的细菌，但不一定表现出症状。这些细菌中的一些与我们在医院菌株中发现的非常相似。
我们试图理解为什么人们的肠道和鼻子里会携带耐抗生素细菌。我们观察大肠杆菌和其他细菌，以及耐甲氧西林葡萄球菌。MRSA感染在医院很常见。它们可以迅速扩散并引起并发症。未经治疗的MRSA可能是致命的。
(当我们研究)大肠杆菌时，我们会研究这种细菌对哪种抗生素组合有耐药性，然后是哪些基因或因素导致了耐药性。
半岛电视台:进行研究的环境有多重要?
Dr Omulo:我想弄清楚:如果你不是在医院里，但你携带了这些抗菌素耐药性细菌，这是什么原因?为什么(这些微生物)会进入某些人体内，而不是其他人体内?
我找到了三篇在其他国家做过的研究文章:玻利维亚、厄瓜多尔和秘鲁。他们研究了一个社区内发生的事情。他们没有发现抗生素耐药性和抗生素使用之间的显著关系。
所以我把这个问题转移到肯尼亚的背景下问是什么导致了这里的问题。我发现其中一个问题是卫生。
在卫生条件差的地方，人们摄入[微生物]，携带它们，并在同一环境中排出它们并传播它们。
半岛电视台:基贝拉的情况如何?作为一名研究人员，为什么你对这个棚户区特别感兴趣?
Dr Omulo:基贝拉是检验假设的好地方，即在抗生素耐药性的传播周期中，卫生与抗生素的使用一样重要，甚至更重要。
在2019年的人口普查中，基贝拉的人口密度为每平方公里6.6万人。如果你想想纽约市，它的人口密度是每平方公里11000人，那么基贝拉的人口密度几乎是它的6倍。所以人们几乎是住在彼此的上面。你真的没有办法把自己和生病的邻居分开，因为你们住得很近。
在基贝拉，许多家庭都是3米乘3米的大小，可以容纳多达11口之家。我想我最多见过15个人住在一个共用的房间里。但平均来说，是5到7个人。
这些主要是用泥建造的锡屋。有几间铺着瓷砖地板，但它是不同建筑材料的大杂烩。所以这不是你的常规结构的房子，这就是非正式定居点的特点。
卫生设施真的很差，因为在世界各地的许多贫民窟，很难有清洁、稳定的供水系统和下水道系统。这种环境确实推动了传播，不仅推动了耐药细菌的传播，还推动了一般疾病的传播。
(在基贝拉)抗生素既便宜又充足，一些小贩只是到处卖抗生素。
从本质上讲，我们发现当我们从人们身上收集样本，测试他们的水，测试他们的环境时，我们在环境中发现了很多这种抗药性细菌。当我们对该地区的土壤样本进行测试时，它有很多耐药细菌。
一般来说，我们想知道，在这个人群中发生了什么可能导致AMR。
半岛电视台:你在那里发现了什么?
Dr Omulo:2016年，当我们对大约200个家庭进行分析时，我们每两周随访一次，持续了五个月，我们发现AMR和抗生素使用之间没有关系。我们确实发现了与环境传播因素的直接关系。因此，即使抗生素的使用在抗菌素耐药性中发挥了作用，环境中恶劣的卫生条件甚至可能掩盖了抗菌素耐药性的作用。背景很重要。
似乎有一些遗传因素或个体的易感性，要么保护他们，要么使他们更容易感染这些细菌。因此，如果你体内有一种(抗菌素)耐药性细菌，你就更有可能被(另一种)耐药性细菌感染。
半岛电视台:你最有趣的发现是什么?
Dr Omulo:我研究了两种不同的环境——基贝拉的贫民窟和更多的农村环境。[Omulo还从维多利亚湖附近的Asembo农村农场的人们身上收集样本。]
我们在这两种情况下提出了广泛的问题，因为我们进行的是同一项研究。我们询问人们饲养什么动物，试图了解这是否会导致抗生素耐药性。
所以，如果你报告家里有家禽——鸡——而大多数农村家庭报告家里养了某种家禽，那么抗菌素耐药性的发病率也更高。
这本身并不是一个令人惊讶的发现，因为抗菌素耐药性传播与家禽饲养之间的关系已经被其他几项研究记录下来。
但我们发现的另一个关系是，对于那些说他们去过医疗机构的家庭，无论是出于医疗原因还是非医疗原因，他们比没有去过医疗机构的家庭更容易携带AMR细菌。
所以看来医疗机构扮演着一定的角色。但我们不确定是什么。是不是当你携带这些细菌时，你更有可能去医疗机构?还是与医疗机构的接触更有可能导致携带病毒?所以现在我们正在跟踪这些人，特别是母亲和她们的孩子，为期一年。每两周，我们收集样本，但我们也会问他们关于水的卫生，个人卫生，抗生素的使用，动物接触等问题，试图了解孰先孰后。
我们试图询问(非致命微生物)的定植是否会以任何方式影响你的健康。与未被殖民的人相比，它是否会导致更多的腹泻发作?它会导致更多的呼吸道感染吗?对于儿童，我们正在跟踪他们的成长里程碑，以确定与未被殖民的儿童相比，被殖民的儿童是否更不可能达到或跟上成长里程碑。
我们也在试图了解殖民过程。人们是一直被殖民还是只在特定的时间被殖民?
所以这一阶段的研究非常详细，与同一个人进行了更多的互动，试图了解殖民化如何影响他们的日常活动或影响他们的健康。
一般来说，在社区环境中，驱动抗菌素耐药性的因素与在医院环境中驱动抗菌素耐药性的因素非常不同。
半岛电视台:我们已经听到很多关于抗生素耐药性是一个紧迫的全球威胁;联合国正在大会上讨论这个问题。你觉得自己是全球推动了解抗生素耐药性的一部分吗?
Dr Omulo:我是世界卫生组织邀请的四个肯尼亚人之一，他们试图找出在全球范围内抗菌素耐药性的研究重点应该是什么。
我认为，我们所做的工作对全球对抗生素耐药性的理解所起的重要作用是，我们不能忽视社区中正在发生的事情。在人们离开医院之前和之后，他们来自一个社区，之后他们又回来了。所以所有发生在那里的过程都对你在医院里看到的有影响。
这是否意味着如果你停止使用抗生素，[AMR]就会消失?绝对不是。有很多研究表明，抗生素耐药性在停止使用抗生素多年后仍然存在于环境中。
因此，在我们理解这个问题之前，我们只是触摸了大象的一部分，而没有意识到大象是一种更大的动物，有不同的纹理部分。
为简洁明了，本采访经过编辑。